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GoogleAnalyticsとAdwordsのアカウントが異なる場合の、GoogleAnalytics上でのAdwordsのリンク設定について書いています。
Googleさんのヘルプページ(https://support.google.com/analytics/answer/1033961?hl=ja)があるのですが、若干迷いましたので、メモとして書いています。

GoogleAnalyticsとAdwordsを別アカウントで連携(リンク)する際に注意すべき点は、「Adwordsは管理者権限」「GoogleAnalyticsは編集権限か管理者権限」を持っているアカウントでないとリンクできないという点です。

ややこしいので言い換えると、一つのアカウントが「Adwordsは管理者権限」「GoogleAnalyticsは編集権限か管理者権限」の両方を持っている必要があり、Adwordsのリンク設定を行えるのは「Adwordsの管理者権限」を持っているアカウントでGoogleAnalyticsにログインしている必要があるということです。

GoogleAnalyticsに移動する

GoogleAnalyticsの管理者権限を持っているアカウントでログインする。

GoogleAnalyticsのユーザーを追加

「ユーザー管理」から「Adwordsの管理者権限」を持っているメールアドレスを追加して「編集権限か管理者権限」にする。

Adwordsの管理者権限を持っているアカウントでログイン

「Adwordsの管理者権限」を持ってるアカウントでログイン(Googleアカウントにログイン)して、GoogleAnalyticsに移動する。
そして、メニュー上部の「アナリティクス設定」に移動する。

リンクしたいGoogleAnalyticsのアカウントを選択

AdwordsとリンクしたいGoogleAnalyticsのアカウントを選択する(画像の赤丸部分)。

リンクしたいGoogleAnalyticsのプロパティを選択

AdwordsとリンクしたいGoogleAnalyticsのプロパティを選択する(画像の赤丸部分)。

リンクしたいAdwordsアカウント番号を選択

Adwordsのリンク設定(画像の赤丸部分)から、リンクしたいAdwordsアカウント番号を選択し(Adwordsの管理画面に表示されているアカウントの番号。Adwordsの管理者権限を持っているアカウントが表示される)、手順に沿って設定を進める。